人類基因圖譜的完成得力資訊科技的幫助

Celera Genomics、Sanger Centre和Whitehead Institute以及美國(guó)健康協(xié)會(huì)(National Institute of Health)日前宣布，已經(jīng)完成人類基因排序，并強(qiáng)調(diào)這項(xiàng)歷史性的科學(xué)成就，得力於康柏電腦的卓越運(yùn)算技術(shù)。這項(xiàng)歷史性的研究所使用的超級(jí)電腦，就是執(zhí)行Tru64 UNIX以及TruCluster軟體的Compaq AlphaServers。

Celera執(zhí)行長(zhǎng)J. Craig Venter在美國(guó)表示：「這是人類有史以來，首度以線狀形式排列人體基因。」Celera將32億對(duì)基因依照正確順序排列，完成了迄今最大的運(yùn)算挑戰(zhàn)。

在排序過程中，Celera采用了超過600個(gè)康柏Alpha伺服器，每秒可執(zhí)行將近一兆個(gè)作業(yè)程序，由於演算作業(yè)與資料儲(chǔ)存需要64 gigabytes的分散式記憶體，所以最後的排序運(yùn)算采用康柏全新AlphaServer GS160。

位於英國(guó)的Sanger Centre，乃由Wellcome Trust與英國(guó)醫(yī)學(xué)研究評(píng)議會(huì)(British Medical Research Council)共同成立，在研究過程中需要能夠承擔(dān)繪制基因圖譜與編排人類基因序列挑戰(zhàn)的運(yùn)算架構(gòu)。於是，Sanger資訊技術(shù)主管Phil Butcher提出了三項(xiàng)選擇原則：延展性、適應(yīng)性以及發(fā)展彈性。

Sanger最初的架構(gòu)包括160臺(tái)康柏Alpha工作站、4套康柏AlphaServer 1200系統(tǒng)，和一個(gè)可執(zhí)行BLAST (基本的本地排序搜尋工具)的小型個(gè)人電腦叢集，支援網(wǎng)際網(wǎng)路基因資料庫(kù)的搜尋存取。

該中心不斷地補(bǔ)強(qiáng)運(yùn)算基層架構(gòu)，最後總共采用了將近250部執(zhí)行Tru64 UNIX的康柏AlphaServer與工作站、1部擁有4個(gè)TeraByte磁碟空間的StorageWorks Raid系統(tǒng)、1部300 GB Network Appliances Raid子系統(tǒng)，以及48臺(tái)康柏Deskpro個(gè)人電腦。

本文由 CTIMES 同意轉(zhuǎn)載，原文鏈接: http://www.ctimes.com.tw/DispCols/cn/AlphaServers/%E5%BA%B7%E6%9F%8F%E8%AE%A1%E7%AE%97%E6%9C%BA/%E9%9D%9EPC%E4%B8%BB%E6%9C%BA/%E4%B8%80%E8%88%AC%E6%80%A7%E4%BC%BA%E6%9C%8D%E4%B8%BB%E6%9C%BA/0006281640ZB.shtml