Google醫(yī)療AI工具DeepVariant走上云端

　　由Google Brain與Verily Life Sciences打造，用來提高基因組測(cè)序準(zhǔn)確性的工具DeepVariant，現(xiàn)在可以透過Google云端平臺(tái)(Google Cloud Platform;GCP)取得， 為DeepVariant的普及應(yīng)用目標(biāo)奠定基礎(chǔ)。

　　據(jù)Healthcare IT News報(bào)導(dǎo)，開發(fā)團(tuán)隊(duì)在Google云端平臺(tái)上部署開源版本的DeepVariant，并采用可擴(kuò)展的Pipelines API，優(yōu)化成本和達(dá)到快速周轉(zhuǎn)的目的。 為用戶在當(dāng)前的運(yùn)算環(huán)境中探索和評(píng)估DeepVariant的功能，同時(shí)提供云端解決方案，滿足基因組龐大數(shù)據(jù)集的需求。

　　DeepVariant透過高通量測(cè)序的準(zhǔn)確性，解決精密醫(yī)學(xué)當(dāng)前面臨的最大挑戰(zhàn)之一。 開發(fā)人員DePristo與Poplin表示，30億堿基對(duì)基因組中只有100個(gè)基因，每個(gè)堿基的錯(cuò)誤率在0.1~10%之間，所有配對(duì)的堿基被組織成23對(duì)染色體。

　　為了構(gòu)建DeepVariant，Google Brain團(tuán)隊(duì)首先從GIAB(Genome in a Bottle Consortium)組織的參考基因組開始，創(chuàng)建數(shù)千萬個(gè)編碼高通量測(cè)序數(shù)據(jù)的示例。 下一步是培訓(xùn)Google TensorFlow分類模型來區(qū)分真正的基因組和實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。

　　2016年DeepVariant在美國食品藥品監(jiān)督管理局(FDA)發(fā)起的PrecisionFDA Truth Challenge競賽中拿到第一名，從那時(shí)起Google就將DeepVariant錯(cuò)誤率降低50%以上。

　　微軟(Microsoft)與匹茲堡大學(xué)醫(yī)學(xué)中心合作發(fā)展人工智能(AI)并發(fā)布新產(chǎn)品包括HealthVault Insights、Microsoft Genomics、聊天機(jī)器人與Project InnerEye之后， 于2017年9月在英國成立專注醫(yī)療保健的人工智能實(shí)驗(yàn)室。

　　而IBM Watson自2015年收購Phytel和Explorys以來，一直專注在醫(yī)療保健人工智能，并為超級(jí)計(jì)算機(jī)的產(chǎn)品組合添加華生基因體學(xué)方案Watson for Genomic和腫瘤解決方案Watson for Oncology。

　　Google的目標(biāo)是將技術(shù)應(yīng)用在醫(yī)療保線與其他科學(xué)應(yīng)用上，最終讓工具與數(shù)據(jù)提供給更多人使用。 DeepVariant是利用Google的運(yùn)算能力和機(jī)器學(xué)習(xí)來理解基因組，并為社群提供更深入基于學(xué)習(xí)的基因組學(xué)工具。