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          基于OpenVINO的海信醫(yī)療 CAS 計(jì)算機(jī)輔助手術(shù)胸肺系統(tǒng)

          作者: 時(shí)間:2020-11-05 來源:英特爾 收藏

          要點(diǎn)綜述
            人工智能等數(shù)字化技術(shù)正在深度重構(gòu)醫(yī)療行業(yè),從醫(yī)學(xué)影像輔助診斷、疾病預(yù)測(cè)/健康管理到藥物研發(fā)等諸多環(huán)節(jié),數(shù)字化技術(shù)都發(fā)揮著日趨重要的作用,帶來更加智慧、高效、精確的診療方式。其中,三維手術(shù)規(guī)劃系統(tǒng)通過醫(yī)療影像中解剖結(jié)構(gòu)智能分割、三維重建及渲染,能夠幫助醫(yī)生更精準(zhǔn)定位手術(shù)位置,判斷手術(shù)可行性,并規(guī)劃最優(yōu)手術(shù)路徑,可有效提高腫瘤切除率、修正手術(shù)方案、大大減少手術(shù)時(shí)間及術(shù)中出血,提高手術(shù)安全性,造福病患。
            青島海信醫(yī)療設(shè)備股份有限公司(以下簡(jiǎn)稱:海信醫(yī)療)是海信集團(tuán)全資子公司,公司與青島大學(xué)共建了數(shù)字醫(yī)學(xué)與計(jì)算機(jī)輔助手術(shù)省級(jí)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,專注于與醫(yī)學(xué)影像相關(guān)的人工智能技術(shù)開發(fā),形成了以醫(yī)學(xué)影像處理、人工智能、信息交互、醫(yī)用顯示等核心技術(shù)為基礎(chǔ),以計(jì)算機(jī)輔助手術(shù)系統(tǒng)、智能影像中心、數(shù)字化手術(shù)室等醫(yī)院信息化解決方案為落地場(chǎng)景的完整研發(fā)、生產(chǎn)、營(yíng)銷服務(wù)體系。海信醫(yī)療多年致力于醫(yī)學(xué)影像人工智能技術(shù)研發(fā),成功開發(fā)出海信計(jì)算機(jī)輔助手術(shù)規(guī)劃系統(tǒng),覆蓋胸肺、肝膽胰脾和泌尿系統(tǒng),已應(yīng)用于全國(guó)100多家醫(yī)院,服務(wù)病患超過9000例(根據(jù)2020年2月的數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)),產(chǎn)生了良好的社會(huì)及經(jīng)濟(jì)效益,具有良好的臨床應(yīng)用前景。
            為了進(jìn)一步提升 CAS 手術(shù)胸肺系統(tǒng)針對(duì) CT(電子計(jì)算機(jī)斷層掃描)人工智能器官分割的效率,提高部署靈活性并控制大規(guī)模部署成本,海信醫(yī)療部署了英特爾?至強(qiáng)?可擴(kuò)展處理器,并使用?工具套件進(jìn)行了算法深度學(xué)習(xí)加速,成功達(dá)到了預(yù)期目標(biāo)。
          背景:CAS 手術(shù)在中國(guó)與全球市場(chǎng)的發(fā)展現(xiàn)狀與預(yù)測(cè)
            隨著近年來低劑量螺旋CT早期篩查普及率的提高,越來越多癌前病變的小結(jié)節(jié)被檢出。與此同時(shí),肺癌的外科治療也經(jīng)歷了從一側(cè)全肺切除、解剖性肺葉切除到肺楔形段切除的發(fā)展演變。
            從解剖學(xué)上講,肺段是一個(gè)完整和獨(dú)立的單位,每個(gè)肺段都有其獨(dú)立的動(dòng)脈、靜脈及支氣管分支供應(yīng),精準(zhǔn)切除腫瘤所在的肺段,既能保證腫瘤的完整切除,又能最大限度的保留正常肺組織,還能進(jìn)行段間及段內(nèi)淋巴結(jié)的采樣或清掃,達(dá)到解剖性切除、根治腫瘤的目的。研究表明,針對(duì)如臨床I期非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)治療等,解剖性肺段切除術(shù)與傳統(tǒng)肺葉切除相比,可以提供類似的局部和遠(yuǎn)端控制1,2。因此,精準(zhǔn)肺 段切除非常適合肺小結(jié)節(jié)或無法耐受肺葉切除病人的治療。
            由于肺臟邊緣動(dòng)靜脈、支氣管分支特別復(fù)雜,且缺乏天然可見的解剖邊界,精準(zhǔn)肺段切除術(shù)具有較大技術(shù)和解剖學(xué)難度。基于深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)自動(dòng)分割的肺部精準(zhǔn)三維重建技術(shù)可以將肺組織、病灶、肺內(nèi)血管和支氣管等結(jié)構(gòu)的形態(tài)和空間分布等進(jìn)行識(shí)別與分析,實(shí)現(xiàn)直觀準(zhǔn)確的可視化呈現(xiàn)。使用三維重建技術(shù)的3D CT 手術(shù)計(jì)劃對(duì)機(jī)器人輔助節(jié)段切除術(shù)非常有用,有利于減少并發(fā)癥和提高手術(shù)效率。
            術(shù)前精準(zhǔn)三維重建可有效顯示病灶及附近解剖結(jié)構(gòu),為肺癌患者提供了更多的選擇,能夠最大限度地保留患者的肺功能。針對(duì)早期肺癌和癌前病變,通過精準(zhǔn)肺段切除能以最小代價(jià)提前實(shí)施干預(yù),切除病灶,增加患者的長(zhǎng)期生存率,提高患者生活質(zhì)量。實(shí)例驗(yàn)證顯示,解剖性肺段分析可有效確定腫瘤體積、所在肺段位置并幫助醫(yī)生預(yù)測(cè)切緣。切緣預(yù)測(cè)陽性準(zhǔn)確率對(duì)腫瘤切緣高于1cm或者切緣腫瘤直徑比大于1的情況,切緣準(zhǔn)確率(TP/(TP+FP))分別達(dá)到87%及75%,可有效輔助醫(yī)生術(shù)前精確判斷周圍型肺癌肺段切除可行性。
            為了支持醫(yī)療影像的自動(dòng)分割,研究人員使用了 NiftyNet 等基礎(chǔ)架構(gòu)來開發(fā)深度學(xué)習(xí)方案,NiftyNet 使研究人員能夠快速開發(fā)和分發(fā)用于分段、回歸、圖像生成和表示學(xué)習(xí)應(yīng)用程序的 深度學(xué)習(xí)解決方案,或?qū)⑵脚_(tái)擴(kuò)展到新的應(yīng)用程序6 。
            據(jù)美國(guó)聯(lián)合市場(chǎng)研究(Allied Market Research)機(jī)構(gòu)最近公布的一份研究報(bào)告預(yù)測(cè),全球術(shù)前規(guī)劃軟件市場(chǎng)規(guī)模2018年為8409萬美元,到2026年這個(gè)數(shù)字將達(dá)到1.27億美元,復(fù)合年增長(zhǎng)率為5.2%。
            胸肺 CT 三維重建是 AI 技術(shù)在醫(yī)療行業(yè)的典型應(yīng)用。事實(shí)上,由于AI在診療過程中具備突出的優(yōu)勢(shì),其已成為眾多醫(yī)院推進(jìn)數(shù)字化創(chuàng)新、推動(dòng)智慧醫(yī)院建設(shè)的重要方向?!吨袊?guó)醫(yī)學(xué)影像 AI 白皮書》顯示,在醫(yī)學(xué)影像方面,AI 技術(shù)具有更廣闊的落地場(chǎng)景,通過 AI 技術(shù),可以有效提高醫(yī)師診療效率與診斷精 度,使醫(yī)學(xué)影像的分析技術(shù)下沉,縮短患者就診等待時(shí)間,降低患者就醫(yī)成本。
            開展精準(zhǔn)肺段切除的最大難點(diǎn)在于個(gè)體解剖差異, 如何分辨肺段的靜脈、動(dòng)脈、支氣管及段間平面是手術(shù)是否精準(zhǔn)的關(guān)鍵。隨著人工智能技術(shù)的發(fā)展, 國(guó)內(nèi)少數(shù)醫(yī)院通過將 CT 數(shù)據(jù)影像導(dǎo)入計(jì)算機(jī)工作站,建立起三維立體數(shù)字器官模型,真實(shí)還原了患者的動(dòng)脈、靜脈及支氣管的走形形態(tài),手術(shù)過程中能夠在電腦中旋轉(zhuǎn)觀察,準(zhǔn)確定位并精準(zhǔn)切除病灶,同時(shí)也大大提升了手術(shù)的安全性?!?彭忠民 山東省立醫(yī)院東院胸外科主任
          海信醫(yī)療基于英特爾架構(gòu)加速三維神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)預(yù)測(cè)
            海信醫(yī)療 CAS 計(jì)算機(jī)輔助手術(shù)胸肺系統(tǒng)可以為腹腔精準(zhǔn)外科手術(shù)提供高效、精準(zhǔn)、易用的影像重建及量化模擬分析整體解決方案。該系統(tǒng)能夠針對(duì)腹腔組織器官的 CT/MR 影像進(jìn)行預(yù) 處理和分割,精準(zhǔn)輸出清晰的肝臟、腫瘤、血管及周邊器官組織的重建結(jié)果,并提供多種模擬手術(shù)工具進(jìn)行直接 3D 切割、2D 映射切割和流域分析,為臨床醫(yī)生快速精準(zhǔn)地進(jìn)行診斷和制定方案提供了有力的輔助工具。

          本文引用地址:http://www.ex-cimer.com/article/202011/420005.htm

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          圖 1. 利用海信醫(yī)療 CAS 完成的胸肺 CT 三維重建模型。圖片由海信醫(yī)療提供

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          圖 2. 海信醫(yī)療 CAS 計(jì)算機(jī)輔助手術(shù)胸肺系統(tǒng)。圖片由海信醫(yī)療提供

            面向重大肝臟疾病的計(jì)算機(jī)輔助手術(shù)系統(tǒng)進(jìn)行的匯總分析顯示,海信計(jì)算機(jī)輔助手術(shù)系統(tǒng)和其它同類產(chǎn)品已向臨床醫(yī)護(hù)人員提供幫助。
            海信醫(yī)療 CAS 計(jì)算機(jī)輔助手術(shù)胸肺系統(tǒng)的設(shè)計(jì)采用功能原型設(shè)計(jì)、性能優(yōu)化、準(zhǔn)確性比對(duì)的步驟進(jìn)行。系統(tǒng)采用了V-Net 神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)架構(gòu)來進(jìn)行全卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的三維圖像分割,利用 NiftyNet 進(jìn)行快速的算法原型設(shè)計(jì),在功能驗(yàn)證的基礎(chǔ)上,進(jìn)一步利用英特爾工具進(jìn)行性能優(yōu)化,并對(duì)優(yōu)化后預(yù)測(cè)結(jié)果與優(yōu)化前預(yù)測(cè)結(jié)果進(jìn)行對(duì)比,以確保優(yōu)化后的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的一致性。
          V-Net
            大多數(shù)醫(yī)學(xué)影像數(shù)據(jù)是三維體數(shù)據(jù),能夠提取三維特征對(duì)于管道類組織的分割至關(guān)重要,這是因?yàn)檠?、支氣管等管道類組織在單張 CT 影像上往往呈現(xiàn)圓形或橢圓形截面,而其主要的形態(tài)特征存在于 z 軸方向。同時(shí)醫(yī)學(xué)圖像分割經(jīng)常存在目標(biāo)組織解剖結(jié)構(gòu)體積占比小,樣本間不均衡現(xiàn)象,如:肺支氣管、肺小結(jié)節(jié)相比肺實(shí)質(zhì),從而帶來預(yù)測(cè)偏差。 V-Net 神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)由 Milletari et al. 在 2016 年提出,輸入圖像經(jīng)過一個(gè)圖像壓縮路徑進(jìn)行特征提取及降采樣操作,連接一個(gè)圖像解壓縮路徑將圖像恢復(fù)到輸入圖像大小,形成左右對(duì)稱的 V 字神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)架構(gòu)。壓縮及解壓路徑間通過特征前項(xiàng)短接 保留細(xì)顆粒特征,提升邊緣的預(yù)測(cè)準(zhǔn)確率。通過引入基于Dice系數(shù)的目標(biāo)函數(shù)進(jìn)行參數(shù)優(yōu)化,可有效處理前景/背景體素不平衡現(xiàn)象。
          NiftyNet
            NiftyNet 是基于TensorFlow 的開源卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(CNN)平臺(tái),通常用于醫(yī)學(xué)影像分析和影像引導(dǎo)療法的研究。海信醫(yī)療使用 NitfyNet 以及其內(nèi)部開放模型庫(Model Zoo)中的 Dense-Vnet 實(shí)現(xiàn)對(duì)于腹部 CT 中多個(gè)器官影像的分割,該神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)平臺(tái)可分割腹部 CT 上的八種類型的器官,包括胃腸道(食道、胃、十二指腸),胰腺和附近的器官(肝、膽、脾、 左腎)。

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          圖 3. V-Net 神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)架構(gòu)圖

            NiftyNet 的開放模型庫提供了可在 TensorFlow 之上,使用標(biāo)準(zhǔn)公共數(shù)據(jù)集訓(xùn)練模型的步驟,以及用于驗(yàn)證模型推理和性能評(píng)估的權(quán)重文件(checkpoint 文件)。在本案例中,英特爾幫助海信醫(yī)療修改 NiftyNet 的公共源代碼來序列化 TensorFlow 模型圖,并生成將權(quán)重固化到模型圖的pb文件。工具套件需要使用在通用框架(Caffe, Tensorflow,MXNet,ONNX)上訓(xùn)練好的模型來進(jìn)行轉(zhuǎn)換,所以在開始使用之前,需要基于TensorFlow將 NiftyNet 模型源碼生成模型圖并固化權(quán)重,以便進(jìn)行后續(xù)的工作。在深度網(wǎng)絡(luò)圖形序列化步驟中,需要指定正確的輸入和輸出節(jié)點(diǎn),使得生成的權(quán)重固化文件中只包含從正確輸入節(jié)點(diǎn)到正確輸出節(jié)點(diǎn)之間的模型結(jié)構(gòu)圖。以下流程圖反映了如何將 NiftyNet 公開模型使用 OpenVINO 加速的過程,其中橙色部分表示在 NiftyNet 源文件中編寫代碼完成的流程,藍(lán)色部分表示 OpenVINO 優(yōu)化流程:

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          圖 4.NiftyNet模型使用OpenVINO優(yōu)化性能的流程圖。約 14.7x 的性能提高細(xì)節(jié)請(qǐng)參考圖 9

          使用 OpenVINO 工具套件分發(fā)來加速模型推斷
            OpenVINO 工具套件發(fā)行版提供了高度優(yōu)化的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)計(jì)算能力,并基于包括英特爾 CPU、GPU、VPU 和 FPGA 在內(nèi)的英特爾硬件平臺(tái),加速了深度學(xué)習(xí)模型推理。英特爾幫助海信醫(yī)療使用了英特爾? 深度學(xué)習(xí)部署工具包(英特爾? DLDT)。 該工具包是 OpenVINO 工具套件中的主要推理優(yōu)化模塊。
            如圖5所示,英特爾 DLDT 包含兩個(gè)模塊,模型優(yōu)化器(MO,Model Optimizer)和推理引擎(IE,Inference Engine)。模型優(yōu)化器是一個(gè)跨平臺(tái)的命令行工具,可實(shí)現(xiàn)訓(xùn)練和部署環(huán)境之間的轉(zhuǎn)換,執(zhí)行靜態(tài)模型分析并調(diào)整深度學(xué)習(xí)模型, 致力于在終端目標(biāo)設(shè)備上實(shí)現(xiàn)最佳執(zhí)行能力。它支持從流行的框架(包括 TensorFlow 模型)到中間數(shù)據(jù)格式(IR,Intermediate Representation)的離線模型轉(zhuǎn)換。

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          圖 5. OpenVINO 工具套件的深度學(xué)習(xí)部署 相關(guān)的產(chǎn)品架構(gòu)

            中間數(shù)據(jù)格式包含用于描述深度學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)的 XML 和用于存儲(chǔ)權(quán)重值和偏差值的二進(jìn)制文件,可以使用推理引擎在英特爾至強(qiáng)可擴(kuò)展處理器上加載和執(zhí)行模型網(wǎng)絡(luò)。推理引擎提供統(tǒng)一的跨平臺(tái) C++ 和 Python API,用于推理加速和優(yōu)化。在英特爾?處理器上,IE將自動(dòng)在運(yùn)行時(shí)使用集成了英特爾?深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)庫(英特爾? DNNL)的運(yùn)行插件,該插件均為動(dòng)態(tài)函數(shù)庫,可以在運(yùn)行時(shí)檢測(cè)指令集架構(gòu)(ISA),并使用準(zhǔn)時(shí)制代碼生成(JIT)來部署,針對(duì)最新的 ISA12 進(jìn)行優(yōu)化,以加速神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)中各層的運(yùn)算。
            圖 6 展示了在 CPU 平臺(tái)上,英特爾 DLDT 的加速推理的機(jī)制和流程,其中推理引擎使用到的MKL-DNN(又稱英 特爾 DNNL)插件中定義了深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)核心的原始操作(primitive operation)層的實(shí)現(xiàn),其中包括卷積層(Conv,Convolution),對(duì)位操作層(Eltwise,element-wise),全連接層(Concat,Concatenation)等。
          OpenVINO 異步模式
            為了高度優(yōu)化整個(gè)推理流程并降低數(shù)據(jù)傳輸成本,海信醫(yī)療采用推理引擎的異步應(yīng)用程序編程接口(Async API)來設(shè)置多個(gè)推理請(qǐng)求對(duì)象的實(shí)例,并在多個(gè)處理器核上并行進(jìn)行推理。該模式可將CT影像分割成多個(gè)小塊進(jìn)行處理(每個(gè)小塊的尺寸為 64*64*64),并且每?jī)蓚€(gè)小塊之間都不會(huì)存在數(shù)據(jù)相互依賴性,這意味著系統(tǒng)可以在開始時(shí)加載成批的塊,并將其注入推理請(qǐng)求池以便并行計(jì)算,而無需等待逐個(gè)數(shù)據(jù)的輸入或等待其他推理實(shí)例完成。這里提供了方便快捷的響應(yīng)機(jī)制,一旦異步推理請(qǐng)求完成推理執(zhí)行時(shí),這組運(yùn)算的結(jié)果將被獲取和記 錄,下一組輸入將直接注入推理請(qǐng)求池進(jìn)行下一輪推理。

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          圖 6. 英特爾 DLDT 基于 CPU 平臺(tái)上的優(yōu)化機(jī)制

            圖 7 顯示了使用英特爾? VTune工具包,通過程序熱點(diǎn)(hotspot)分析選項(xiàng),分析原始的推理引擎同步(Sync)API程序的運(yùn)算情況。網(wǎng)絡(luò)層在主線程上執(zhí)行,英特爾DNNL將為在多個(gè)內(nèi)核上進(jìn)行計(jì)算的每一個(gè)網(wǎng)絡(luò)層創(chuàng)建英特爾? TBB 線程。從OpenVINO工具套件2019R1版本開始,DLDT 將默認(rèn)的并行化機(jī)制從 OpenMP 轉(zhuǎn)移到英特爾 TBB,旨在為多網(wǎng) 絡(luò)場(chǎng)景和異步及吞吐量模式下的推理運(yùn)算提供更高的性能。
            圖 7 中黃色圓圈圈中的一欄代表主線程,橫軸表示時(shí)常,橙色 的內(nèi)容表示主線程處于空轉(zhuǎn)的狀態(tài)下,線程占據(jù)了系統(tǒng)資源,

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           圖 7. VTune 工具展示的 OpenVINO IE Sync API 計(jì)算過程

            原因是主線程需要等待,直到下面的TBB子線程逐層地完成,并且每小塊的輸入數(shù)據(jù)將被逐一計(jì)算后,主線程才可以結(jié)束運(yùn)算并釋放資源。
            與 Sync API 相比,Async API 可以創(chuàng)建多個(gè)推理請(qǐng)求實(shí)例來同時(shí)執(zhí)行網(wǎng)絡(luò)推理。如圖 8 所示,Async API 將同時(shí)創(chuàng)建帶有多個(gè)推理請(qǐng)求的線程,每個(gè)線程分別使用不同的輸入數(shù)據(jù)塊執(zhí)行推理,圖像中的紅色圓圈表示同一個(gè)網(wǎng)絡(luò)層在不同推理實(shí)例上的并行情況。通過使用這種方式,將減少主線程和子線程之間的等待時(shí)延。

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           圖 8. VTune 工具展示的 OpenVINO IE Async API 計(jì)算過程(“吞吐量” 模式打開)

            同時(shí),海信醫(yī)療還使用處理器推理引擎的“吞吐量”(Throughput)模式在 CPU上同時(shí)高效地運(yùn)行多個(gè)推理請(qǐng)求,從而大大提高了吞吐量。使用該模式,執(zhí)行資源會(huì)被固定到執(zhí)行“流”中,而這些“流”的可以綁定在CPU物理核上, “流”的數(shù)量建議設(shè)置為 CPU 的物理核數(shù)。通過此功能將容易 獲得更高性能,尤其是在多核服務(wù)器上。
          基于OpenVINO工具套件的海信醫(yī)療CAS性能驗(yàn)證
            要對(duì) CT 等醫(yī)療影像進(jìn)行三維重建,需要采集目標(biāo)的點(diǎn)云數(shù)據(jù) (Point Cloud Data,PCD),經(jīng)過深度影像增強(qiáng)、點(diǎn)云計(jì)算與配準(zhǔn)、數(shù)據(jù)融合、表面生成等步驟,完成對(duì)目標(biāo)的三維重建計(jì)算,其涉及到影像人工智能自動(dòng)分割、重建,需要部署 人工智能預(yù)測(cè)網(wǎng)絡(luò),對(duì)于計(jì)算資源、存儲(chǔ)和網(wǎng)絡(luò)連接有著巨大的需求。
            在選擇人工智能預(yù)測(cè)網(wǎng)絡(luò)的基礎(chǔ)設(shè)施時(shí),用戶常常會(huì)面臨是選擇 CPU 還是 GPU的困擾。GPU的并行架構(gòu)適合處理圖像算法,也普遍被用于深度學(xué)習(xí)訓(xùn)練中,但是由于醫(yī)療場(chǎng)景的特殊性,GPU 并非是面向三維重建的人工智能預(yù)測(cè)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 的必然選擇:
            ? 醫(yī)院部署人工智能功能往往局限于醫(yī)院局域網(wǎng),很難利用公網(wǎng)中的廉價(jià) GPU資源。為了滿足并發(fā)需求,部署多塊高性能 GPU 是不小的硬件成本。
            ? 通常GPU顯存有限,針對(duì)三維神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)預(yù)測(cè)的大數(shù)據(jù)量,需要采用拆分-單獨(dú)預(yù)測(cè)-合并的 Patch-based 方法,這樣容易丟失所預(yù)測(cè)目標(biāo)的上下文信息,引入噪聲。如胸肺動(dòng)靜分割,數(shù)據(jù)量(512*512*400),使用只有 11GB 顯存的 GPU(海信醫(yī)療評(píng)估系統(tǒng)設(shè)置),最大Patch尺寸為(232*232*232)。部署時(shí)該GPU的適配性不高。
            ? 本案例中的海信醫(yī)療 CAS 手術(shù)系統(tǒng)的AI算法有較強(qiáng)的批處理屬性,人為交互少,可以允許損失一部分處理時(shí)間而不影響用戶體驗(yàn)。
            ? GPU 通用性有一定的限制,僅能用于定制的AI運(yùn)算,平時(shí)不能利用。使用 CPU 服務(wù)器可有效利用空置資源,提供其他閱片室或者手術(shù)室服務(wù)。
            因此,選擇恰當(dāng)?shù)娜S神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)預(yù)測(cè)的基礎(chǔ)設(shè)施平臺(tái),并通過深度學(xué)習(xí)加速工具包來加速預(yù)測(cè)性能,就成為三維重建手術(shù)規(guī)劃系統(tǒng)部署的重要因素。
            基于英特爾至強(qiáng)可擴(kuò)展處理器以及 OpenVINO 工具套件,海信醫(yī)療與英特爾共同優(yōu)化了胸肺CT人工智能自動(dòng)分割、重建算法,在可接受的性能指標(biāo)范圍內(nèi),大大降低了CAS計(jì)算機(jī)輔助手術(shù)胸肺系統(tǒng)部署成本與靈活性。
            在發(fā)現(xiàn)GPU方案可能存在的弊端之后,海信醫(yī)療決定基于英特爾至強(qiáng)可擴(kuò)展處理器來搭建基礎(chǔ)設(shè)施平臺(tái),并對(duì)該方案的性能進(jìn)行評(píng)估。英特爾至強(qiáng)可擴(kuò)展處理器不僅擁有強(qiáng)大的通用計(jì)算能力,還集成了增強(qiáng)單指令多數(shù)據(jù)流(Single Instruction Multiple Data,SIMD)、英特爾? AVX-512 等創(chuàng)新技術(shù),實(shí)現(xiàn)了對(duì)于通用計(jì)算能力和并行計(jì)算能力的兼顧,為人工智能訓(xùn)練提供了卓越的性能基礎(chǔ)。相比上一代產(chǎn)品,英特爾至強(qiáng)可擴(kuò)展處理器針對(duì)人工智能訓(xùn)練和推理可提供大幅領(lǐng)先的性能。
            此外,海信醫(yī)療還使用OpenVINO工具套件進(jìn)行了加速,OpenVINO工具套件包括英特爾深度學(xué)習(xí)部署工具套件。通過輸入來自標(biāo)準(zhǔn)網(wǎng)絡(luò)的訓(xùn)練后模型,模型優(yōu)化器可將其轉(zhuǎn)換為統(tǒng)一的中間代碼(IR)文件,然后在推理引擎上運(yùn)行該文件, 這有助于跨不同加速器進(jìn)行測(cè)試,無需重新編碼。
            為了驗(yàn)證該方案的性能表現(xiàn),海信醫(yī)療進(jìn)行了對(duì)比測(cè)試(其中,CPU方案采用了英特爾至強(qiáng)可擴(kuò)展處理器,搭載了英特爾?SSE4.2、英特爾?AVX、英特爾? AVX2、英特爾AVX-512指令集,并使用OpenVINO工具套件進(jìn)行了優(yōu)化,結(jié)果如圖 9 所示)。在方案中,CT 影像原圖為尺寸為(284,512,512),即284張 512*512 的 CT 影像切片。海信醫(yī)療 CAS 應(yīng)用 NiftyNet 中的 GridSampler 函數(shù)將該 CT 影像原始切片分成了1001個(gè)64*64*64 的小塊進(jìn)行深度學(xué)習(xí)推理。
            測(cè)試結(jié)果顯示 CPU 方案具備更高的部署與應(yīng)用靈活性,可以承擔(dān)更廣泛的負(fù)載,更有效地控制系統(tǒng)的總體擁有成本(TCO)。

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          圖 9. 缺省NiftyNet和OpenVINO工具套件優(yōu)化前后的推理性能對(duì)比。數(shù)據(jù)由海信醫(yī)療于 2020 年 1 月提供

          效果實(shí)例:8分鐘完成疑難病癥手術(shù)關(guān)鍵核心環(huán)節(jié)
            通過英特爾至強(qiáng)可擴(kuò)展處理器、OpenVINO工具套件來優(yōu)化胸肺CT人工智能自動(dòng)分割,海信醫(yī)療 CAS 計(jì)算機(jī)輔助手術(shù)系統(tǒng)的效率與精度得到了有效保證。通過對(duì)于胸肺 CT 進(jìn)行三維重建,該系統(tǒng)可形成立體360度可量化、可觀察、可互動(dòng)的影像模型,醫(yī)生可以通過旋轉(zhuǎn)、調(diào)整透明度、縮放等方式對(duì)于影像模型進(jìn)行更加細(xì)致的觀察,為術(shù)前規(guī)劃、術(shù)中參考提供重要支撐。
            海信醫(yī)療副總經(jīng)理陳永健指出,近日在中國(guó)重慶醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院泌尿外科的一例“腎癌伴下腔靜脈癌栓并浸潤(rùn)腔靜脈壁”疑難手術(shù)中,患者病情的特殊性讓醫(yī)生找不到同類手術(shù)進(jìn)行參考,施行手術(shù)的風(fēng)險(xiǎn)極高。通過引入海信醫(yī)療 CAS 計(jì)算機(jī)輔助手術(shù)系統(tǒng)進(jìn)行三維重建,醫(yī)生進(jìn)行了充分的術(shù)前規(guī)劃準(zhǔn)備,最終手術(shù)關(guān)鍵環(huán)節(jié)僅用時(shí)8分鐘就順利完成。
            基于海信醫(yī)療在醫(yī)療行業(yè)深厚的積累,以及英特爾架構(gòu)所帶來的高性能、靈活性與敏捷性,該系統(tǒng)在胸肺類疾病的診斷中可以發(fā)揮出巨大潛力,幫助醫(yī)生提升臨床手術(shù)的質(zhì)量。對(duì)于醫(yī)院而言,該解決方案也可以有效利用醫(yī)院內(nèi)部的通用計(jì)算資源,節(jié)省相應(yīng)支出。
            2020 年1月份,青島大學(xué)附屬醫(yī)院和海信醫(yī)療聯(lián)合科研團(tuán)隊(duì)共同開發(fā)的,基于海信醫(yī)療 CAS 計(jì)算機(jī)輔助手術(shù)系統(tǒng)的“基于小兒肝膽胰計(jì)算機(jī)輔助手術(shù)系統(tǒng)研發(fā)、臨床應(yīng)用及產(chǎn)業(yè)化”成果,榮獲 2019 年度國(guó)家科技進(jìn)步獎(jiǎng)二等獎(jiǎng)。
          展望:英特爾與海信醫(yī)療推動(dòng)的落地
            “三維重建的技術(shù)優(yōu)勢(shì)在疾病診斷中的效率、準(zhǔn)確性優(yōu)勢(shì)日漸顯現(xiàn)。通過與英特爾進(jìn)行合作,我們確保了該系統(tǒng)的運(yùn)行效率以及敏捷性。而在未來,我們也將與英特爾合作探索 3D 打印、混合現(xiàn)實(shí)等技術(shù)在醫(yī)療行業(yè)的應(yīng)用,為術(shù)前精確診斷、術(shù)中精準(zhǔn)手術(shù)、患者快速康復(fù)提供更大的支持保障”,海信醫(yī)療副總經(jīng)理陳永健表示。
            為推進(jìn)人工智能在醫(yī)療健康領(lǐng)域的廣泛應(yīng)用,英特爾推出了CPU、FPGA、Myriad?視覺處理器及一系列的軟件開發(fā)工具,具備全面的人工智能產(chǎn)品組合和端到端的技術(shù)實(shí)力,可以提供高度靈活和多種優(yōu)化的解決方案,并充分發(fā)揮合作伙伴們?cè)诟髯灶I(lǐng)域的專業(yè)性,來推動(dòng)人工智能醫(yī)療技術(shù)的落地與進(jìn)一步發(fā)展。



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