3min全面了解植物次生代謝物——分類、功能、檢測
1.什么是Plant specialized metabolites?
Plant specialized metabolites是物種特異性的化合物(也稱為次生代謝物),有助于植物適應和在不斷變化的生態(tài)環(huán)境中生存。同時,很多物質具有生物活性,廣泛當作天然藥物使用。次生代謝物結構多樣,通常根據其生物合成來源進行分類,主要有萜類、苯丙類、脂肪酸衍生物和氨基酸衍生物(圖1)。
圖1 植物特異性物質類別[1]
2.Plant specialized metabolites具有什么功能?
雖然次生代謝物的確切數量目前尚不清楚,研究報道數量可能在20萬到100萬種之間。次生代謝物的合成和儲存受到發(fā)育和時間的調控,并依賴于生物和非生物因素。例如在玉米的非生物脅迫(干旱、重金屬)和生物脅迫(昆蟲、細菌等)中均有特異性物質的參與(圖2)。
圖2 玉米中參與不同功能的特異性物質[2]
3.plant specialized metabolites怎么檢測?
植物特異性物質(次生代謝物)主要包括黃酮、萜類、生物堿、香豆素、木脂素、硫甙糖苷等類型。邁維代謝基于國家專利技術(專利號:201010562426.8)廣泛靶向?代謝組,開發(fā)出行業(yè)領先的植物代謝組產品“植物廣泛靶向?代謝組”,更好滿足科研工作者的需求。
①檢測技術
植物特異性物質種類繁多,同時部分物質含量低,因此對于這些物質的檢出需要同時滿足兩個條件:通量高(檢出物質多)、靈敏度高(低含量的物質可以檢出)。目前有3個主流代謝物檢測技術:非靶向代謝組、靶向代謝組、廣泛靶向代謝組。非靶向代謝組雖然通量足夠高,靈敏度上卻低于靶向代謝組;靶向代謝組雖然靈敏度高,但是通量卻遠不如非靶向代謝組,“廣泛靶向代謝組”結合以上兩種技術優(yōu)勢,實現“高通量”、“超靈敏”、“廣覆蓋”檢測樣本中代謝物。
②數據庫
目前,植物代謝物標準品尤其是次生代謝物標準品數量大概在幾千個,而且價格昂貴,限制了植物代謝組的發(fā)展。邁維代謝通過十年的積累,積累了35000個物質數據庫:初生代謝物2200個(包括糖/核苷酸/脂質/氨基酸等)和次生代謝物33000個(包括黃酮/萜類/生物堿/香豆素/木脂素等)。同時,積累了344個植物科屬的項目經驗,有助于研究者挖掘物種特色代謝通路、鑒定到有重要生物學功能的物質。
③項目經驗
積累了344個植物科屬的項目經驗,有助于挖掘物種特色代謝通路、鑒定到有重要生物學功能的物質、講有價值的學術故事。除了這些植物特異性物質的檢出以外,我們也同樣交付物種專屬物質(例如番茄中的茄堿、擬南芥中的硫甙糖苷等)。除了檢測到具有植物特色的物質以外,同時能檢測到物種特色物質,這些物質信息能讓我們的研究有差異,更有創(chuàng)新的研究價值。
④實際案例
植物特異性物質與植物的生長發(fā)育、非生物脅迫、生物脅迫等各個方面都息息相關,因此我們在閱讀文章的過程中也會發(fā)現,特異性物質檢出及分析可以為文章添加亮點。除了這些植物特異性物質可以為研究增加亮點以外,物種特色物質也是新增亮點的一個重要部分。
邁維小結
這樣看來,在不同物種、組織植物特異性物質存在巨大的差異,因此對于這類物質的檢出有助于我們更加深入的了解植物適應環(huán)境變化的機制。
Huang XQ, Dudareva N. Plant specialized metabolism. Curr Biol. 2023 Jun 5;33(11):R473-R478.
Yasmin F, Cowie AE, Zerbe P. Understanding the chemical language mediating maize immunity and environmental adaptation. New Phytol. 2024 Sep;243(6):2093-2101.
評論