比傳統(tǒng)CPU快140倍，NVIDIA提升研究速度

作者：時間：2008-08-01 來源：網(wǎng)絡(luò)

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　　GeForce GPU（圖形 處理器）運(yùn)行Folding@home蛋白質(zhì)模擬的速度斯坦福大學(xué)分布式計算項目Folding@home通過將數(shù)百萬顆處理器的強(qiáng)大計算性能應(yīng)用在其蛋白質(zhì)折疊模擬工作中，成為從事研究癌癥、囊腫性纖維化以及帕金森綜合癥等致命疾病治療手段隊伍中的一支重要力量。Folding@home項目是GPU（圖形 處理器）越來越多地應(yīng)用于非游戲領(lǐng)域的一個最新例子。在NVIDIA GeForce GPU（圖形處理器）上運(yùn)行Folding@home客戶端的實際結(jié)果表明，蛋白質(zhì)折疊模擬工作的速度比當(dāng)今的CPU快140倍。

　　斯坦福大學(xué)化學(xué)系副教授兼Folding@home項目總監(jiān)Vijay Pande表示：“GeForce GPU（圖形處理器）對蛋白質(zhì)折疊模擬的影響是巨大而深遠(yuǎn)的。使用GeForce GPU（圖形處理器）來模擬蛋白質(zhì)折疊的團(tuán)隊實現(xiàn)了其生產(chǎn)效率的極速飆升。在Folding@home中應(yīng)用如此強(qiáng)大的處理性能徹底改變了這一項目，極大地縮短了我們進(jìn)行生物醫(yī)學(xué)研究所需的時間。”

　　為了處理盡可能多的數(shù)據(jù)，F(xiàn)olding@home項目聚集了大量組隊競賽的計算機(jī)發(fā)燒友。ExtremeOverclocking.com網(wǎng)站統(tǒng)計并顯示了這些團(tuán)隊的非官方統(tǒng)計數(shù)字。NVIDIA（英偉達(dá)）內(nèi)部折疊模擬團(tuán)隊僅用了10臺機(jī)器、花了兩周時間就超越了90%的團(tuán)隊。NVIDIA（英偉達(dá)）團(tuán)隊添置了更多GPU（圖形處理器）之后，就全時生產(chǎn)效率而言，該團(tuán)隊在不到一個月的時間內(nèi)就躋身于僅占總數(shù)0.1%的頂級團(tuán)隊行列。

　　其他蛋白質(zhì)折疊團(tuán)隊在使用了NVIDIA Folding@home客戶端后也實現(xiàn)了其排名的提升。

　《PC Games Hardware》編輯Carsten Spille表示：在許多隊員安裝了NVIDIA Folding客戶端之后，我們PC Games Hardware蛋白質(zhì)折疊團(tuán)隊實現(xiàn)了在同樣時間內(nèi)的工作量翻倍。我們每天都能超越許多團(tuán)隊，最終實現(xiàn)了我們躋身世界折疊團(tuán)隊100強(qiáng)的目標(biāo)?！?

　　蛋白質(zhì)折疊
　　蛋白質(zhì)可以通過一種方法聚集起來，而這種方法就是生物學(xué)家所謂的“折疊”。Folding@home項目的目標(biāo)是了解蛋白質(zhì)折疊、誤折疊以及相關(guān)的疾病。Folding@home模擬蛋白質(zhì)折疊就是為了了解蛋白質(zhì)如何快速可靠地折疊以及蛋白質(zhì)不正確折疊的后果。阿耳茨海默氏病、囊腫性纖維化、瘋牛病（BSE）、遺傳肺氣腫以及多種癌癥等疾病均被認(rèn)為是由蛋白質(zhì)誤折疊所造成。